《可塑性记忆》的故事背景设定在人类与拥有情感的人形智能机器人共存的时代。主人公水柿司进入了一家名为SAI社的公司，主要负责回收即将到达使用期限的机器人。在工作中，他结识了机器人艾拉，两人成为搭档。司和艾拉在回收任务中经历了各种各样的故事，也逐渐加深了彼此的感情。然而，艾拉也有着自己的使用期限，随着时间的推移，这个期限越来越近。司努力想要延长艾拉的使用时间，却面临着重重困难。他们在有限的时间里，一起面对离别，在相处过程中学会了珍惜当下，最终艾拉到达使用期限，平静地离开了司。这段经历让司成长，也让他更加懂得了生命和情感的珍贵。
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